يتم استخدام مواد متنوعة لقياس الالكترونيات الجزيئية، بما في ذلك:
1- السيليكون (Silicon): يستخدم في صناعة شرائح الكمبيوتر والأجهزة الإلكترونية الأخرى.
2- النحاس (Copper): يستخدم في تصنيع الأسلاك والموصلات والمسطحات الإلكترونية.
3- الجرافين (Graphene): يمتاز بخفة وزنه وقوته العالية وأدائه الممتاز كموصل. ويستخدم في تصنيع أجهزة الكمبيوتر والأجهزة الإلكترونية الأخرى.
4- المواد النانوية (Nanomaterials): تشمل عددًا من المواد الخاصة المستخدمة في صناعة الالكترونيات الجزيئية، مثل النانوتكنولوجي والنانوسليكون والنانوذهب والنانوفضة. وتستخدم على نطاق واسع في صناعة الأقراص الصلبة والشاشات اللمسية وغيرها من الأجهزة الإلكترونية.