ترتبط الكيمياء فوق الجزيئية بتقنية النانو بعدة طرق. فمن خلال استخدام تقنيات الكيمياء الفوق جزيئية يمكن تحضير المواد النانوية بشكل دقيق وبتحكم دقيق في حجم الجسيمات وشكلها وخواصها الفيزيائية والكيميائية. ويمكن استخدام تلك المواد النانوية لتحسين الخواص الفيزيائية والكيميائية للعديد من الأشياء مثل الأجهزة الإلكترونية والأطعمة والأدوية والمواد الكيميائية الأخرى.
كما يمكن استخدام الكيمياء الفوق جزيئية في تصميم وتصنيع النانو أجهزة مثل حساسات الغازات والحساسات الحرارية النانوية والأدوات الطبية النانوية والمواد النانوية التي تستخدم في صناعة البطاريات والخلايا الشمسية والأشياء الأخرى.
وبشكل عام فإن الكيمياء الفوق جزيئية تعد أداة قوية لتحقيق تماسك الجزيئات وتنظيمها وبالتالي تحقيق أحجام جزيئية صغيرة جدًا وخواص فريدة جدًا بفضل التوزيع الدقيق للمواد فوق سطح الجزيئي. ويمكن استخدام الكيمياء الفوق جزيئية في تصميم المواد النانوية بذات الأسلوب الذي يتم استخدامه في صناعة الأدوية والأدوات الطبية.
