هناك عدة قواعد لتسمية المركبات العضوية، ومن أهمها:
1- تسمية السلاسل الرئيسية: يجب تحديد السلسلة الرئيسية التي تحتوي على أكبر عدد من الذرات الكربون المتتالية وتسميتها.
2- تسمية فروع السلسلة الرئيسية: يجب تحديد موضع الفروع الحلقية أو الخارجية في السلسلة الرئيسية بالترتيب الأبجدي، ووضع اسم الفرع متبوعًا برقم يوضح موضع الذرة الكربونية التي ترتبط به.
3- تسمية المجموعات الوظيفية: يجب تحديد المجموعات الوظيفية الموجودة في المركب وتسميتها باستخدام اسم الفئة العضوية التي تمثل.
4- تسمية المضافات: يمكن أن تحتوي المركبات العضوية على مضافات مثل الهيدروكسيل أو الكيتونات أو الألدهيدات، ويتم وضع اسم المضافة بعد اسم السلسلة الرئيسية متبوعًا بموقع ارتباط المضافة مع الذرة الكربونية في السلسلة الرئيسية.