توجد العديد من المشاكل الشائعة التي تتعلق بأجهزة الإدخال والإخراج ، ومن بين هذه المشاكل :
1- تعذر توصيل الجهاز بالحاسب الآلي لعدم وجود منفذ متوافق معه.
2- عدم التعرف على الجهاز الموصل بواسطة الحاسوب الآلي.
3- ظهور رسائل الخطأ أثناء استخدام الجهاز.
4- عدم عمل الجهاز بشكل صحيح، مما يؤدي إلى توقفه أو تشويشه في التعامل مع الحاسوب.
5- عدم عمل تحديثات البرامج التي تحتاج إليها هذه الأجهزة.
6- تعطل الأسلاك أو التوصيلات بسبب الإهمال أو استخدامها الخاطئ.
7- ارتفاع درجة حرارة الأجهزة، ولذلك ينصح بتحديد مكان مناسب لها في أطراف الحاسوب وتجنب تركيبها بالقرب من المعالج.
8- وجود تعارض في وظيفة الجهاز مع التطبيقات الأخرى، وينحل هذا المشكلة بتحديد الأولويات وإجراء التعديلات اللازمة في إعدادات النظام.
