هناك العديد من الطرق المستخدمة في إدارة الخوادم، ومن بينها:
1- إدارة الخوادم عن بُعد (Remote Server Management): تسمح هذه الطريقة بإدارة الخادم من خلال الاتصال بشبكة الإنترنت عبر برامج التحكم عن بعد مثل Remote Desktop Protocol (RDP) أو Virtual Network Computing (VNC) أو SSH.
2- لوحات التحكم (Control Panels): يمكن للمستخدمين إدارة الخوادم باستخدام لوحات التحكم المتاحة من المزودين، مثل cPanel، Plesk، WHM والتي توفر واجهة بسيطة وسهلة الاستخدام.
3- الحلول المتكاملة (Integrated Solutions): هذه الحلول تتيح إدارة الخوادم المتعددة عبر منصة واحدة باستخدام أدوات مثل Microsoft System Center و IBM Tivoli.
4- الأتمتة (Automation): يتم استخدام الأتمتة لتحديث وإدارة الخوادم بصورة أكثر فعالية مثل استخدام حزم البرامج النصية والأدوات مثل Ansible و Chef.
5- تكامل البرامج (Software Integration): تستخدم هذه الطريقة لتوحيد البرامج المختلفة المستخدمة في إدارة الخوادم عبر استخدام يوجد برامج تزامن بين بعضها البعض وتتيح تبادل المعلومات وتوحيد الإدارة لتقديم أوقات التشغيل بشكل أفضل وأمن أكثر.