تتضمن الأنظمة المستخدمة في تشغيل السيارات الهيدروجينية:
1- نظام تخزين الهيدروجين: يتم تخزين الهيدروجين في أنابيب أو صهاريج خاصة في السيارة.
2- محول الوقود: يقوم بتحويل الهيدروجين إلى كهرباء وماء.
3- بطارية السيارة: تستخدم البطارية لتخزين الطاقة الكهربائية المولدة من محول الوقود.
4- محرك السيارة: يستخدم الكهرباء المخزنة في البطارية لتشغيل محرك السيارة الكهربائي.
5- نظام التحكم: يتحكم في تشغيل وإيقاف السيارة ويحافظ على استخدام كمية الوقود اللازمة لتشغيل المحرك والحفاظ على كفاءة استخدام الطاقة.