توجد العديد من الخوارزميات المستخدمة في تنقيب البيانات، ومن بينها:
1- خوارزمية الشجرة القرارية (Decision Tree Algorithm)
2- خوارزمية الشبكات العصبونية الاصطناعية (Artificial Neural Networks Algorithm)
3- خوارزمية الانحدار الخطي (Linear Regression Algorithm)
4- خوارزمية الانحدار اللوجستي (Logistic Regression Algorithm)
5- خوارزمية الكتل الذرية (Apriori Algorithm)
6- خوارزمية الكسر الأمامي (Naive Bayes Algorithm)
7- خوارزمية الشبكات العصبونية العميقة (Deep Neural Networks Algorithm)
8- خوارزمية التجمع الهرمي (Hierarchical Clustering Algorithm)
9- خوارزمية الكشف عن الانحدار (Regression Detection Algorithm)
10- خوارزمية التصنيف الشجري (Classification Tree Algorithm)
تختلف هذه الخوارزميات في الطريقة التي تستخدمها في تحليل البيانات واستخلاص المعلومات منها، ويتم اختيار الخوارزمية المناسبة حسب نوع البيانات والأهداف المرجوة من التحليل.