تشمل أهم أدوات الإدارة الهندسية المستدامة ما يلي:
1- تحليل الأثر البيئي (Environmental Impact Assessment): وهو عملية تقييم شاملة لتأثير المشروع الهندسي على البيئة، وتشمل جميع المراحل اللازمة لتطوير المشروع.
2- تقييم الأداء البيئي (Environmental Performance Assessment): وهو عملية قياس وتحليل أداء المشاريع الهندسية من حيث الأثر البيئي، ويتم ذلك من خلال متابعة المؤشرات البيئية وتحليلها.
3- التصميم الهندسي المستدام (Sustainable Engineering Design): وهو تصميم المشروع الهندسي بطريقة تسهم في تحسين الأداء البيئي والاقتصادي والاجتماعي للمنطقة المحيطة بالمشروع.
4- إدارة المخلفات (Waste Management): وهي عملية التخلص من المواد الضارة والخطرة التي تنتج عن المشروع الهندسي، ويتم ذلك بطريقة تضمن عدم التأثير على البيئة المحيطة.
5- إدارة المياه (Water Management): وهي عملية تنظيم استخدام المياه في المشروع الهندسي بطريقة تحافظ على الموارد المائية وتقلل من الأثر البيئي.
6- إدارة الطاقة (Energy Management): وهي عملية توفير الطاقة وتقليل استهلاكها في المشروع الهندسي، وذلك بتطبيق تقنيات الطاقة المتجددة والتحسينات في الكفاءة الطاقوية.