توجد عدة طرق لعزل مصادر المواد الضارة في الخوادم والسيرفرات، ومن أهمها:
1- تحديث البرامج والأنظمة المستخدمة بشكل دوري، حيث تقوم الشركات المصنعة بإصلاح الثغرات الأمنية وتحسين البرامج بشكل مستمر.
2- تثبيت برامج مكافحة الفيروسات والبرامج الضارة، وتحديثها بشكل دوري لتتمكن من اكتشاف وحجب الهجمات.
3- تقسيم الخوادم والسيرفرات إلى عدة جزء، وعدم السماح للمستخدمين بالوصول إلى أجزاء معينة من الخادم، وإعطاء كل مستخدم صلاحيات محددة ومناسبة له.
4- الاعتماد على نظام حماية الحوائط النارية Firewall، والذي يعمل على تصفية الحركة المرورية ومنع الوصول غير المصرح به إلى الخادم أو الشبكة.
5- تنظيم عمليات النسخ الاحتياطي Backup بشكل دوري، لتتمكن من استعادة البيانات والمعلومات في حالة وقوع هجوم أو خسارة للبيانات.