تصميم الخوارزمية في تحليل البيانات الضخمة هو عملية تحديد وتحديد الخوارزميات المناسبة التي يمكن استخدامها لتحليل البيانات الكبيرة بفعالية وكفاءة. وهذا يتطلب دراسة تفصيلية لإمكانيات ومتطلبات البيانات المحلولة وكذلك دراسة الخوارزميات المتوفرة وتحديد الأنسب والأسرع والأكثر دقة وفعالية. يتم تصميم هذه الخوارزميات بطريقة تضمن تحليل البيانات على نحو سلس ودقيق وفي وقت قصير. وتتنوع الخوارزميات التي يمكن استخدامها، من بينها الشبكات العصبية والتحليل الإحصائي وتقنيات الذكاء الاصطناعي والتعلم الآلي، وغيرها الكثير.