تستخدم الأعداد الرياضية في تشفير البيانات باستخدام معادلات وأساليب الرياضيات المختلفة. فعلى سبيل المثال، يمكن استخدام الأعداد الأولية وتحويلاتها لتشفير الرسائل، أو استخدام أساليب التشفير المتقدمة مثل خوارزميات التشفير الرياضية القوية مثل RSA وAES. كما يمكن استخدام الرياضيات لتوليد مفاتيح التشفير وفك تشفير الرسائل المشفرة. في العمليات المشفرة، يتم تحويل البيانات إلى شكل رياضي ومن ثم يتم تشفيرها باستخدام مفاتيح التشفير المناسبة. عندما تتم عملية فك التشفير، يتم استخدام مفاتيح التشفير نفسها لإعادة تحويل البيانات المشفرة إلى شكلها الأصلي. بمثل هذه الطرق، يمكن بسهولة حماية البيانات والرسائل الحساسة من الوصول غير المصرح به.