تحكم في سرعة المضخة الوقود عادة يتم عن طريق نظام إلكتروني يسمى وحدة التحكم الإلكتروني للمحرك (ECU). هذا النظام يستشعر بيانات متعددة مثل معدل التدفق الهوائي، درجة حرارة المحرك، وضغط العادم لتحديد كمية الوقود التي يجب إرسالها إلى المحرك. يتم ضبط معدل تدفق الوقود بواسطة فتح وإغلاق فوهات المضخة الوقود أو تثبيت الضغط. يمكن أيضًا ضبط سرعة المضخة الوقود عن طريق تغيير إعدادات البرمجة في وحدة التحكم الإلكتروني للمحرك.