توجد العديد من المدارس العلمية الشيعية في إيران، ومن بينها:
1- حوزة النجف الأشرف، وهي أكبر حوزة شيعية في العالم بحيث تقع في مدينة النجف الأشرف بالعراق، وتمتلك فروعًا في إيران والبحرين ولبنان وغيرها.
2- حوزة قم المقدسة، وتعد ثاني أكبر حوزة شيعية في العالم، وتقع في مدينة قم المقدسة في إيران.
3- مدرسة الإمام الرضا، وتعد من أحدث المدارس العلمية الشيعية في إيران، وتقع في مدينة مشهد المقدسة.
4- مدرسة المصطفى النابلسي، وتقع في مدينة قم المقدسة وتعتبر من المدارس العلمية الشيعية الحديثة في إيران.
5- حوزة الحجة بن الحسن العسكري، وتقع في مدينة مشهد المقدسة وتعد من المدارس العلمية الشيعية الرائدة في إيران.