هناك العديد من الخوارزميات الحاسوبية التي يستخدمها خبراء التشفير، ومن أشهرها:
1- AES (Advanced Encryption Standard): وهو أحدث نوع من خوارزميات التشفير القوية والشائعة استخدامها في الوقت الحالي.
2- RSA (Rivest–Shamir–Adleman): وهي طريقة تستخدم في التشفير العام وفك التشفير الخاص، وهي كانت أول خوارزمية تم استخدامها في التشفير العام.
3- Blowfish: وهو خوارزمية تشفير نموذجية تستخدم في العديد من الأنظمة والبرامج.
4- Twofish: وهو خوارزمية يتم استخدامها في التشفير القوي للبيانات والملفات الكبيرة.
5- DES (Data Encryption Standard): وهي أول خوارزمية تم استخدامها في التشفير البيانات، ولكنها تعتبر الآن أقل أمانًا ويفضل استخدام خوارزميات أحدث.