تختلف التكاليف المرتبطة بالتعليم الخاص من مدرسة لأخرى حسب المنطقة الجغرافية ونوع الخدمات التي تقدمها المدرسة. ومن بين التكاليف الرئيسية التي قد تقابلها في التعليم الخاص:
1- الرسوم الدراسية التي تغطي تكاليف الدورات الدراسية والأنشطة والخدمات الأخرى اللازمة لتعليم الطلاب.
2- تكاليف النقل (إذا كان المنزل بعيدًا عن المدرسة).
3- تكاليف الإقامة (إذا كان الطالب يسكن في المدرسة).
4- تكاليف التغذية (إذا كان المدرسة تقدم خدمات تغذية).
5- تكاليف الدروس الخصوصية (إذا كان الطلاب بحاجة إلى مساعدة إضافية في المواد الدراسية).
6- تكاليف الجلسات العلاجية (إذا كان الطلاب بحاجة إلى علاج نفسي أو جلسات طبية).
7- تكاليف المعدات التعليمية والمواد الدراسية (مثل الكتب والأدوات الرياضية والموسيقية والحواسيب والبرامج الخاصة).