تخزن قواعد البيانات البيانات بطرق متنوعة اعتمادا على نوع القاعدة والتقنيات المستخدمة، ومنها:
1. تخزين البيانات في ملفات نصية: حيث يتم حفظ البيانات في ملفات نصية مثل ملفات الـ CSV، ويتم استخدامها في بعض برامج الجداول الإلكترونية.
2. تخزين البيانات في قواعد بيانات علاقية: حيث يتم تخزين البيانات في جداول مرتبطة ببعضها عن طريق العلاقات، ويتم استخدام لغة SQL في إضافة وتعديل وحذف البيانات. مثل قواعد البيانات MySQL وOracle وPostgreSQL.
3. تخزين البيانات في قواعد بيانات غير علاقية: حيث يتم تخزين البيانات في هياكل مختلفة مثل المجموعات والمستندات والعقد، وتستخدم تقنيات مختلفة مثل NoSQL. مثل قواعد البيانات MongoDB وCassandra وCouchbase.
يمكن استرجاع البيانات من قاعدة البيانات باستخدام لغات الاستعلام مثل SQL، وتخليص البيانات من التطبيقات الخاصة بقواعد البيانات، وفي بعض الأحيان تحتاج إلى برمجة APIs واستخدامها للاستخدام في تطبيقات الويب أو تطبيقات الموبايل.