توجد العديد من التحديات في مجال الرياضيات الحسابية، ومنها:
1- تطوير النماذج الرياضية الدقيقة التي تعبر عن الظواهر المعقدة في العالم الحقيقي.
2- تحديث أدوات الحساب الثلاثي الأبعاد والإحصائية والتحليلية لتلبية الاحتياجات المتزايدة للمجتمع.
3- دراسة التفاعل بين النظم الحيوية والبيئة وتحليل البيانات المتعلقة بها.
4- تصميم نماذج الذكاء الاصطناعي التي تستند إلى الرياضيات الحسابية لحل المشاكل الصعبة في العلوم والهندسة ومجال الأعمال.
5- معالجة البيانات الضخمة وتحليلها بطريقة سليمة لتحقيق أهداف التحليل الإحصائي والتنبؤية.
6- دراسة الأمن السيبراني لحماية الأنظمة الحسابية وتحسينها للحد من الهجمات المحتملة.
7- تطوير البرامج التعليمية التي تسهم في تعزيز فهم الرياضيات الحسابية وتشجيع المزيد من الطلاب على الدراسة في هذا المجال المهم.