إدارة البيانات

الأدوات والقواعد البيانات المعلوماتية الحيوية تهدف لتحليل وتفسير البيانات الجينية والمعلومات الحيوية المتاحة. وتشمل مثل هذه الأدوات:

1. أدوات تحليل البيانات الجينية: مثل BLAST ، وطرق تعديل الجينات، وعمليات التنبؤ بالبنية الثلاثية للبروتينات.

2. قواعد البيانات المعلوماتية الحيوية: مثل قاعدة البيانات الجينية GenBank وقاعدة البيانات البروتينية PDB، وقاعدة البيانات الحيوية UniProt.

3. البرمجيات الخاصة بقياس التعبير الجيني: مثل رقاقات الحمض النووي الحراري، وإهداءات السلسلة الزمنية.

4. أدوات التداول في النماذج الحسابية: مثل MATLAB وبنية الاتصال المتجهة.

5. أدوات إدخال وإدارة البيانات: مثل Excel وAccess وSQL.

6. أدوات تصميم وإعادة تدوير البرمجيات: مثل Java وPython وRuby.

يمكن استخدام هذه الأدوات والقواعد بشكل متكامل لإجراء الأبحاث الحيوية وتحليل البيانات الجينية والبروتينية.

هناك عدة أنواع من قواعد البيانات وتشمل:

1- قاعدة البيانات الهرمية (Hierarchical database): وهي نوع من قواعد البيانات التي تتبع نمط شجري، حيث يكون لكل بيانات والأكثر من كائن فرعي يحتوي على حقول البيانات الخاصة به.

2- قاعدة البيانات الشبكية (Network database): وهي نوع من قاعدة البيانات التي تتبع نمط شبكي، حيث تتكون من عدة ملفات يربط بينها صلة مشتركة.

3- قاعدة البيانات العلائقية (Relational database): وهي نوع من قواعد البيانات التي تستخدم لإدارة البيانات وتنظيمها وترتيبها وعرضها على شكل جداول تتكون من خلايا محددة.

4- قاعدة البيانات بالصورة (Object database): وهي نوع من قواعد البيانات الذي يسمح بتخزين الكائنات الخاصة على شكل صورة داخل قاعدة البيانات.

5- قاعدة بيانات NoSQL (NoSQL database): وهي قاعدة بيانات غير علائقية وغير شبكية، وغالباً ما تستخدم في تطبيقات الويب، وتتبع نهجًا غير تقليدي في هيكل البيانات ومزودها قادر على تخزين نوعيات مختلفة من البيانات.

6- قاعدة البيانات الموزعة (Distributed database): وتشكل عدة قواعد بيانات متصلة ببعضها البعض وتخزن البيانات بصورة موزعة على عدة أجهزة.

CSV هي صيغة لتخزين البيانات التي تتكون من قيم مفصولة بفواصل (عادة فاصلة). وهي عبارة عن ملف نصي يمكن أن يحتوي على جدول من البيانات بترتيب محدد.

قاعدة البيانات، بالمقابل، هي نظام لتخزين وإدارة البيانات الذي يحتوي على جدول أو جداول من البيانات الرقمية. وتستخدم للبحث وتحليل وتعديل البيانات.

يمكن استخدام CSV لتخزين البيانات في ملف نصي بسيط، بينما تستخدم قاعدة البيانات لتخزين البيانات بطريقة منظمة وحتى تمكين المستخدمين من إدارة وتعديل البيانات. وبالإضافة إلى ذلك، يمكن استخدام قاعدة البيانات لتخزين الكميات الكبيرة من البيانات والتعامل معها بشكل أكثر فعالية وسرعة.