تختلف مصانع الكيمياء العضوية واللاعضوية في عدة نواحي، من أهمها:
1- المصدر: يتم استخراج المواد الخام العضوية من الكائنات الحية، مثل النباتات والحيوانات، بينما يتم الحصول على المواد الخام اللاعضوية من المواد الطبيعية الغير حية، مثل الصخور والمعادن.
2- الخصائص: تحتوي المواد العضوية على الكربون والهيدروجين، بينما تحتوي المواد اللاعضوية على العناصر الكيميائية الأخرى، مثل الكبريت والفوسفور.
3- الاستخدامات: تستخدم المواد العضوية في العديد من المجالات، مثل الطب، والطعام، والمنسوجات، بينما تستخدم المواد اللاعضوية في صناعات البناء والكيماويات الثقيلة.
4- التفاعل: تختلف تفاعلات المواد العضوية واللاعضوية، حيث تحدث تفاعلات كيميائية مختلفة لكل منها.